基因檢測c語言函數(shù) 基因檢測c語言函數(shù)有哪些
c語言怎么寫第一行是一個整數(shù)N，代表有N組測試數(shù)據(jù)，接下來是N行，每行有兩個整數(shù)A和B。
輸入n
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換行;
for循環(huán){
利用隨機(jī)函數(shù)獲取兩個整數(shù)\n；
}
#include stdio.h
int main()
{
int i,N;
scanf("%d",N);
int *t=new int[N];
for(i=0;iN;i++)
scanf("%d",t[i]);
for(i=0;iN;i++)
if(t[i]%2==1)
printf("YES!\n");
else
printf("NO!\n");
return 0;
}
擴(kuò)展資料：
在1-52間每生成一個隨機(jī)數(shù)后，檢查該隨機(jī)數(shù)是否出現(xiàn)過，如果是第一次出現(xiàn)，就放到序列里，否則重新生成一個隨機(jī)數(shù)作檢查。在 excel worksheet里面用這種辦法，會造成if多層嵌套，不勝其煩，在VBA里面做簡單一些，但是效率太差，越到序列的后端，效率越差。
當(dāng)然也有比較好的辦法，在VBA里面，將a(1)-a(52)分別賦予1-52，然后做52次循環(huán)，例如，第s次生成一個1-52間的隨機(jī)數(shù)r，將a(s)與a(r)互換，這樣的話，就打亂了原有序列，得到一個不重復(fù)的隨機(jī)序列。
參考資料來源：百度百科-隨機(jī)函數(shù)
對圖1中l(wèi)一4號個體進(jìn)行基因檢測，將含有該遺傳病基因或正?；虻南嚓P(guān)DNA片段各自用電泳法分離．正?；?/h2>
A、由圖4號為患者，其父母1和2號正常，可判斷該病是常染色體隱性遺傳?。Y(jié)合圖2abcd中abd都具有條帶1和2，c只有條帶2，圖1中123號正常，4號患病，可知4號對應(yīng)的應(yīng)該是C，故A正確．
B、4號個體為常染色體隱性遺傳病患者，沒有該病的正?；?，并且只有條帶2，因此條帶2DNA片段有致病基因，故B正確．
C、根據(jù)圖一可知，設(shè)正?；?yàn)锳，致病基因?yàn)閍，那么1號和 2號的基因型均為Aa，4號為aa．從7號（aa）可以推知5號和6號的基因型均為Aa，那么8號可能有的基因型為AA（1/3）或Aa（2/3），3號基因型為Aa（2/3）由圖2條帶判斷，因此8號個體的基因型與3號個體的基因型相同的概率為2/3，故C正確．
D、9號可能有的基因型為AA（1/3）或Aa（2/3），他與一個攜帶者（Aa）結(jié)婚，孩子患病的概率為1/4*2/3=1/6，故D錯誤．
故選D．
基因檢測中aa，ac.ag是什么意思
佳學(xué)基因普及科技知識，每一個問題都是有理的?；蛐畔⑹峭ㄟ^堿基對來表現(xiàn)的。一個基因通常用兩個字母來表示，一個是來自父親的，一個來自母親。這里應(yīng)當(dāng)是三個不同位置的基因信息。第一個位置是AA,稱之為純合基因，來自父親的和來自母親的是一樣的；AC和AG表明來自父親和來自母親的是不同的。人體是由30億個信息單位組成的，這30億個信息單位，基本上只有四種，即A, G, C, T,分別代表四種核苷酸，即DNA的組成成分。它們是腺苷酸、鳥苷酸、胞苷酸和胸腺核苷酸。
基因芯片信號檢測與數(shù)據(jù)處理（詳細(xì)版）
來回顧一下基因芯片分析的步驟，首先在布滿探針的玻璃平板上加入不同熒光標(biāo)記（Cy3和Cy5）的對照組和實(shí)驗(yàn)組mRNA樣品，與芯片上探針雜交后，再用計(jì)算機(jī)掃描熒光信號，最后進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，分析。
?生物芯片在熒光標(biāo)記的樣本和探針結(jié)合后, 必須用掃讀裝置將芯片測定結(jié)果轉(zhuǎn)變成可供分析處理的圖像數(shù)據(jù)。
1.圖像分析
2.數(shù)據(jù)預(yù)處理
具體過程：
1.激光激發(fā)使含熒光標(biāo)記的DNA片段發(fā)射熒光
2.激光掃描儀或激光共聚焦顯微鏡采集各雜交點(diǎn)的信號
3.軟件進(jìn)行圖象分析和數(shù)據(jù)處理
?生物芯片檢測的目的是將不可見的生物分子的微弱變化通過生物、化學(xué)、光學(xué)、電子和軟件等多學(xué)科交叉技術(shù)的綜合處理，轉(zhuǎn)換成可見的數(shù)字圖像信號，實(shí)現(xiàn)信號的放大、增強(qiáng)和可視化，以便進(jìn)行科學(xué)研究。
掃描儀組成：包括硬件系統(tǒng)和軟件系統(tǒng)
信號 (signal) : 通過檢測一 起獲得的數(shù)字量 輸出 ，對應(yīng)于真實(shí)的實(shí)驗(yàn)分析數(shù)據(jù)。
噪聲 (noise) : 通過檢測儀器的數(shù)字量輸出， 對應(yīng)于背景熒光、暗電流、沖擊噪聲以及其他非實(shí)驗(yàn)分析數(shù)據(jù)。
信噪比（signal-to-noise ratio) : 微陣列檢測過程中信號和噪聲的比值 。
1.數(shù)據(jù)的提取
2.對數(shù)化
3.探針過濾
4.補(bǔ)缺失值
5.標(biāo)準(zhǔn)化
6.探針注釋
7.基因過濾
芯片的熒光掃描圖像信號
一般來說，實(shí)驗(yàn)組一般為疾病樣本，對照組為正常樣本
CH1I? 實(shí)驗(yàn)組信號值
CH1B? 實(shí)驗(yàn)組背景值
CH2I? 對照組信號值
CH2B? 對照組背景值
表達(dá)譜矩陣表達(dá)量計(jì)算：
Ratio=(CH1I-CH1B)/(CH2I-CH2B）
芯片數(shù)據(jù)格式
下列為表達(dá)譜矩陣的一般格式：每一列為一個樣本（sample）的所有基因表達(dá)值，每一行為某個基因在所有樣本的表達(dá)值
原始數(shù)據(jù)呈偏態(tài)分布對數(shù)轉(zhuǎn)化后呈近似正態(tài)分布
去除表達(dá)水平是負(fù)值或很小的數(shù)據(jù)或明顯的噪音數(shù)據(jù)過閃耀現(xiàn)象物理因素導(dǎo)致的信號污染（劃傷，指紋等）
原因：雜交效能低，點(diǎn)樣問題 ……
實(shí)際問題：彗星尾 背景高 粘點(diǎn)問題等
非隨機(jī)缺失（豐度過高或過低）
隨機(jī)缺失（與表達(dá)水平高低無關(guān)）
1.刪除相應(yīng)的行，列
2.簡單補(bǔ)缺法 0/1
3.均值 樣本均值 基因均值
4.k近鄰法
由于會存在系統(tǒng)誤差，需要對芯片進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化
感興趣的變異
真正的生物學(xué)變異
差異表達(dá)基因
混雜變異
實(shí)驗(yàn)過程中引入的變異
在樣本的染色、芯片的制作、芯片的掃描過程中引入的系統(tǒng)誤差
系統(tǒng)誤差來源
染料的物理屬性
染料的結(jié)合效率
探針的制備
探針和樣本的雜交過程
數(shù)據(jù)收集時的掃描過程
不同芯片間的差異
不同芯片雜交條件
標(biāo)準(zhǔn)化過程的參照物穩(wěn)定表達(dá)的基因
持家基因(housekeeping genes)
外源性的或人工合成的控制基因(controls）
芯片上大部分穩(wěn)定表達(dá)的基因(所有基因)
相對穩(wěn)定基因子集( invariant set）
不存在染料偏倚
不存在不同grid帶來的系統(tǒng)誤差
主要為不同芯片間的差異
類似于cDNA芯片
Z-score
MAS 5
RMA
Probe ID 第一列
Gene Symbol 第二列
ENTREZ_GENE ID 第三列
刪除探針對應(yīng)不到基因表達(dá)譜里的行
多個探針對一個基因，表達(dá)值取均值或中值
一個探針對多個基因，刪除行
r語言實(shí)現(xiàn)
probe_namerownames(probe_exp)#提取probeid
locmatch(probeid_geneid[,1],probe_name)#probeid進(jìn)行匹配,30000多個
probe_exp-probe_exp[loc,]#能匹配上的probe的對應(yīng)表達(dá)值
raw_geneid-as.numeric(as.matrix(probeid_geneid[,3]))#每個probeid對應(yīng)的geneid
index-which(!is.na(raw_geneid))#找出有g(shù)eneid的probeid并建立索引
geneid-raw_geneid[index]#提取與geneid匹配的probeid
exp_matrix-probe_exp[index,]#找到每個geneid的表達(dá)值（這里探針對應(yīng)不到基因的行就刪除了）
geneidfactor-factor(geneid)
gene_exp_matrix-apply(exp_matrix,2,function(x) tapply(x,geneidfactor,mean))#多個探針對應(yīng)1個基因的情況，取平均值
rownames(gene_exp_matrix)-levels(geneidfactor)#geneid作為行名
gene_exp_matrix2-cbind(geneid,gene_exp_matrix)
write.table(gene_exp_matrix2,file="geneid_exp.txt",sep="\t",row.names=F)#寫出geneid表達(dá)譜矩陣
＃把gene id轉(zhuǎn)化成gene symbol
locmatch(rownames(gene_exp_matrix),probeid_geneid[,3])#geneid表達(dá)譜矩陣和geneid匹配，建立索引
row.names(gene_exp_matrix)-probeid_geneid[loc,2] ＃行名換成gene symbol
genesymbol-rownames(gene_exp_matrix)
gene_exp_matrix3-cbind(genesymbol,gene_exp_matrix#Gene_symbol這列為表達(dá)譜的行名，并與表達(dá)譜合并
write.table(gene_exp_matrix3,file="genesymbol_exp.txt",sep="\t",row.names=F,quote=F)#寫出genesymbol表達(dá)譜矩陣
基因過濾
波動篩選方差
最小倍數(shù)變化篩選(Minimumfold-change filter) 差異性較小的基因可用該方法去除
此處篩選的標(biāo)準(zhǔn)基于以下條件:滿足表達(dá)量距其在所有芯片上表達(dá)量中位數(shù)相差指定倍數(shù)的基因的個數(shù)，占總基因個數(shù)的比例(故在此需要用戶指定兩個值，比例和倍數(shù))。
少于x%中的表達(dá)水平大于等于中值的y倍(20%，1.5）
內(nèi)容大部分來源于老師PPT和生物信息學(xué)第二版，在這里做總結(jié)歸納
對一道生物題所給信息的疑問。。。
回答：
預(yù)備：對圖1中l(wèi)一4號個體進(jìn)行基因檢測——只是1~4號個體。雖然左圖中一共有4代9個個體。
回答1：“正?；蝻@示一個條帶，患病基因顯示為另一個不同的條帶” ———這句話什么意思？
——這句話的意思是，正常個體（的樣本）基因（就是pb，Base Pair 堿基對）顯示成1條（或2條）可見的條帶，而患病者的則顯示為2條（或1條）。——這是什么意思呢？打個比方：你做過層析實(shí)驗(yàn)吧，就是比如是 紙層析，那么分析的物質(zhì)將在 濾紙 上呈現(xiàn)出 一條一條的分布帶——而對于本題止中所有的項(xiàng)目，就是比如（題目中只說了電泳法，而沒有說用什么材料——比如，是用 瓊脂糖凝膠，還是用 聚丙烯酰胺凝膠 來做電泳的 支持物）瓊脂糖凝膠電泳，將4個個體的樣本，同時、分別，做了對 DNA片段上的基因，進(jìn)行了電泳分離。那么這4個樣品的染色體上（你說DNA上也行）的基因片段（前面說了就是堿基對，英文字母縮寫 pb；不同作用——我們叫控制不同性狀 的基因片段的pb），就會因?yàn)?PH值 和 基因?qū)?shù)目 不同，而發(fā)生 不同速度 的電泳，而在
瓊脂糖凝膠 上奔跑、聚集，呈現(xiàn) 帶著分布——這就是 條帶 咯。
——從右圖我們可以看見，4個個體的4個樣本中，a, b, d這3個樣本（樣本與樣品都是一個意思哈，都是取的樣）各產(chǎn)生了2個條帶，而樣本c只產(chǎn)生了一個條帶——已經(jīng)理解。如果沒有，就想像：一張紙，上面橫著畫了粗細(xì)不同的兩橫，而c只有一橫，這個樣子。
回答2：為什么編號c沒有條帶1？——從左圖及全圖中部指示的 正常與患病 圖示可以看出，在1——4號個體中，1——3號個體為正常，4號為患者，所以，對應(yīng)一下，立即明白：c呀，就是4號個體的樣本呀——因?yàn)樗? 缺失 了某些 同樣功能 的基因片段（堿基對），所以，沒有 條帶1，這就是 4號個體 患病的原因——哦不，差點(diǎn) 形而上 啦！不是 原因，是 證據(jù)！
回答3：——祝你快樂~~假日愉快 *-~
本文名稱：基因檢測c語言函數(shù) 基因檢測c語言函數(shù)有哪些
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