go語言常用庫方法講解 go語言實現(xiàn)

GO數(shù)據庫介紹（轉載）

類似于語義網絡。是為了生物界有一個統(tǒng)一的數(shù)據交流語言。 因為在生物學界，存在在種種同名異義、異議同名的現(xiàn)象。為此產生了GO項目。

十多年的鞍山網站建設經驗，針對設計、前端、開發(fā)、售后、文案、推廣等六對一服務，響應快，48小時及時工作處理。網絡營銷推廣的優(yōu)勢是能夠根據用戶設備顯示端的尺寸不同，自動調整鞍山建站的顯示方式，使網站能夠適用不同顯示終端，在瀏覽器中調整網站的寬度，無論在任何一種瀏覽器上瀏覽網站，都能展現(xiàn)優(yōu)雅布局與設計，從而大程度地提升瀏覽體驗。成都創(chuàng)新互聯(lián)從事“鞍山網站設計”,“鞍山網站推廣”以來，每個客戶項目都認真落實執(zhí)行。

GO是用一套統(tǒng)一的詞匯表來描述生物學中的分子功能、生物過程和細胞成分。其思想大概過程：對于一個基因產品（蛋白質或RNA），用某些詞匯來描述它是干什么的或位于細胞哪里、或者參與了哪個生物過程，而這些詞匯就是來自GO的Term。

（1）提供生物學功能（術語）的邏輯結構及其相互之間的關系，表現(xiàn)為有向無環(huán)圖

（2）給特定的基因產物（蛋白質，非編碼RNA或大分子復合體，簡稱為'基因'）起一個特定的名字（唯一標識該基因）

Gene Ontology（GO）中最基本的概念是term。GO里面的每一個entry都有一個唯一的數(shù)字標記，形如GO:nnnnnnn，還有一個term名，比如"cell", "fibroblast growth factor receptor binding"，或者"signal transduction"。每個term都屬于一個ontology，總共有三個ontology，它們分別是

細胞成分：細胞的部分或其細胞外環(huán)境;

分子功能：基因產物在分子水平上的元素活性，例如結合或催化;

生物過程：具有確定開始和結束的分子事件的操作或集合，與綜合生活單元的功能有關

理由一：

在基因表達譜分析中，GO常用于提供基因功能分類標簽和基因功能研究的背景知識。利用GO的知識體系和結構特點，旨在發(fā)掘與基因差異表達現(xiàn)象關聯(lián)的單個特征基因功能類或多個特征功能類的組合。

根據GO的知識體系，使用“功能類”（或者叫做“功能模塊”）這一概念具有以下優(yōu)點：我們認為，單個基因的表達情況的改變不足以反映特定功能/通路的整體變化情況。因為類似人類社會的組織結構，生物體的功能的實現(xiàn)決不僅僅是依靠一兩個基因功能的改變來實現(xiàn)的。因此過分著重單個基因表達變化，將會在后期結果處理中嚴重干擾對于結果的合理分析，導致偏倚性加大，而且是無法避免的。因此利用GO的結構體系，把參與同樣功能/通路的基因進行“功能類”層面的抽象和整合，提供比基因更高一層次的抽象結論，對理解疾病的發(fā)病機制或藥物的作用機理等更有幫助。

但是該方法也存在一定的不足，由于生物體內部的調控網絡可能具有“scale-free network”的特點，個別功能重要的基因（主效基因）具有“Hub節(jié)點”的重要特性，它的功能改變可能對于整個網絡來說是至關重要的，在這點上，這些重要的基因又具有一定的“自私獨裁”特點。而“功能類”之觀點模糊了這種差別特性，過于強調“共性”，而忽視了“個性”，這也是“功能類”的一個不足之處，這就需要結合相關的生物學知識才能夠實現(xiàn)

理由二：

GO（gene ontology）對大家而言也許會是一個相對陌生的名詞，但是它已經成為生物信息領域中一個極為重要的方法和工具，并正在逐步改變著我們對 biological data的組織和理解方式，它的存在已經大大加快了我們對所擁有的生物數(shù)據的整合和利用，我們應該逐步學會理解和掌握這種思想和工具。

眾所周知，sequence based biology中的核心內容即是對序列的Annotation（注釋），其中主要包含structural annotation和functional annotation，前者涉及分析sequence在genome中的locus以及exon，intron，promoter等的location，而后者則是推斷序列編碼產物的功能

隨著多種生物genome的相繼解碼，同時大量ESTs以及gene expression profile date的積累，使得annotation的工作量和復雜度大大增加。然而另一方面，大多數(shù)基因在不同真核生物中擁有共同的主要生物功能，通過在某些物種中獲得的基因或者蛋白質（shared protein）的生物學信息，可以用以解釋其他物種中對應的基因或蛋白（especially in comparative genomics）。由于這些繁復的功能信息主要是包含在積累的文獻之中，如何有效的提取和綜合這些信息就是我們面臨的核心困難，這也是GO所要著力解決的問題。通過建立一套具有動態(tài)形式的控制字集（controlled vocabulary），來解釋真核基因及蛋白在細胞內所扮演的角色，并隨著生命科學研究的進步，不斷積累和更新。一個ontology會被一個控制字集來描述并給予一定的名稱，通過制定“本體”ontologies并運用統(tǒng)計學方法及自然語言處理技術，可以實現(xiàn)知識管理的專家系統(tǒng)控制

總結：

Gene Ontology（GO）包含了基因參與的生物過程，所處的細胞位置，發(fā)揮的分子功能三方面功能信息，并將概念粗細不同的功能概念組織成DAG（有向無環(huán)圖）的結構。

Gene Ontology是一個使用有控制的詞匯表和嚴格定義的概念關系，以有向無環(huán)圖的形式統(tǒng)一表示各物種的基因功能分類體系，從而較全面地概括了基因的功能信息，糾正了傳統(tǒng)功能分類體系中常見的維度混淆問題。

在基因表達譜分析中，GO常用于提供基因功能分類標簽和基因功能研究的背景知識。利用GO的知識體系和結構特點，旨在發(fā)掘與基因差異表達現(xiàn)象關聯(lián)的單個特征基因功能類或多個特征功能類的組合。

原文：

GO語言（三十）：訪問關系型數(shù)據庫（上）

本教程介紹了使用 Godatabase/sql及其標準庫中的包訪問關系數(shù)據庫的基礎知識。

您將使用的database/sql包包括用于連接數(shù)據庫、執(zhí)行事務、取消正在進行的操作等的類型和函數(shù)。

在本教程中，您將創(chuàng)建一個數(shù)據庫，然后編寫代碼來訪問該數(shù)據庫。您的示例項目將是有關老式爵士樂唱片的數(shù)據存儲庫。

首先，為您要編寫的代碼創(chuàng)建一個文件夾。

1、打開命令提示符并切換到您的主目錄。

在 Linux 或 Mac 上：

在 Windows 上：

2、在命令提示符下，為您的代碼創(chuàng)建一個名為 data-access 的目錄。

3、創(chuàng)建一個模塊，您可以在其中管理將在本教程中添加的依賴項。

運行go mod init命令，為其提供新代碼的模塊路徑。

此命令創(chuàng)建一個 go.mod 文件，您添加的依賴項將在其中列出以供跟蹤。

注意： 在實際開發(fā)中，您會指定一個更符合您自己需求的模塊路徑。有關更多信息，請參閱一下文章。

GO語言（二十五）：管理依賴項（上）

GO語言（二十六）：管理依賴項（中）

GO語言（二十七）：管理依賴項（下）

接下來，您將創(chuàng)建一個數(shù)據庫。

在此步驟中，您將創(chuàng)建要使用的數(shù)據庫。您將使用 DBMS 本身的 CLI 創(chuàng)建數(shù)據庫和表，以及添加數(shù)據。

您將創(chuàng)建一個數(shù)據庫，其中包含有關黑膠唱片上的老式爵士樂錄音的數(shù)據。

這里的代碼使用MySQL CLI，但大多數(shù) DBMS 都有自己的 CLI，具有類似的功能。

1、打開一個新的命令提示符。

在命令行，登錄到您的 DBMS，如下面的 MySQL 示例所示。

2、在mysql命令提示符下，創(chuàng)建一個數(shù)據庫。

3、切到您剛剛創(chuàng)建的數(shù)據庫，以便您可以添加表。

4、在文本編輯器的 data-access 文件夾中，創(chuàng)建一個名為 create-tables.sql 的文件來保存用于添加表的 SQL 腳本。

將以下 SQL 代碼粘貼到文件中，然后保存文件。

在此 SQL 代碼中：

（1）刪除名為album表。 首先執(zhí)行此命令可以讓您更輕松地稍后重新運行腳本。

（2）創(chuàng)建一個album包含四列的表：title、artist和price。每行的id值由 DBMS 自動創(chuàng)建。

（3）添加帶有值的四行。

5、在mysql命令提示符下，運行您剛剛創(chuàng)建的腳本。

您將使用以下形式的source命令：

6、在 DBMS 命令提示符處，使用SELECT語句來驗證您是否已成功創(chuàng)建包含數(shù)據的表。

接下來，您將編寫一些 Go 代碼進行連接，以便進行查詢。

現(xiàn)在你已經有了一個包含一些數(shù)據的數(shù)據庫，開始你的 Go 代碼。

找到并導入一個數(shù)據庫驅動程序，該驅動程序會將您通過database/sql包中的函數(shù)發(fā)出的請求轉換為數(shù)據庫可以理解的請求。

1、在您的瀏覽器中，訪問SQLDrivers wiki 頁面以識別您可以使用的驅動程序。

2、使用頁面上的列表來識別您將使用的驅動程序。為了在本教程中訪問 MySQL，您將使用 Go-MySQL-Driver。

3、請注意驅動程序的包名稱 - 此處為github.com/go-sql-driver/mysql.

4、使用您的文本編輯器，創(chuàng)建一個用于編寫 Go 代碼的文件，并將該文件作為 main.go 保存在您之前創(chuàng)建的數(shù)據訪問目錄中。

5、進入main.go，粘貼以下代碼導入驅動包。

在此代碼中：

（1）將您的代碼添加到main包中，以便您可以獨立執(zhí)行它。

（2）導入 MySQL 驅動程序github.com/go-sql-driver/mysql。

導入驅動程序后，您將開始編寫代碼以訪問數(shù)據庫。

現(xiàn)在編寫一些 Go 代碼，讓您使用數(shù)據庫句柄訪問數(shù)據庫。

您將使用指向結構的指針sql.DB，它表示對特定數(shù)據庫的訪問。

編寫代碼

1、進入 main.go，在import您剛剛添加的代碼下方，粘貼以下 Go 代碼以創(chuàng)建數(shù)據庫句柄。

在此代碼中：

（3）使用 MySQL 驅動程序Config和FormatDSN類型以收集連接屬性并將它們格式化為連接字符串的 DSN。

該Config結構使代碼比連接字符串更容易閱讀。

（4）調用sql.Open 初始化db變量，傳遞 FormatDSN。

（5）檢查來自 的錯誤sql.Open。例如，如果您的數(shù)據庫連接細節(jié)格式不正確，它可能會失敗。

為了簡化代碼，您調用log.Fatal結束執(zhí)行并將錯誤打印到控制臺。在生產代碼中，您會希望以更優(yōu)雅的方式處理錯誤。

（6）調用DB.Ping以確認連接到數(shù)據庫有效。在運行時， sql.Open可能不會立即連接，具體取決于驅動程序。您在Ping此處使用以確認 database/sql包可以在需要時連接。

（7）檢查來自Ping的錯誤，以防連接失敗。

（8）Ping如果連接成功，則打印一條消息。

文件的頂部現(xiàn)在應該如下所示：

3、保存 main.go。

1、開始跟蹤 MySQL 驅動程序模塊作為依賴項。

使用go get 添加 github.com/go-sql-driver/mysql 模塊作為您自己模塊的依賴項。使用點參數(shù)表示“獲取當前目錄中代碼的依賴項”。

2、在命令提示符下，設置Go 程序使用的DBUSER和DBPASS環(huán)境變量。

在 Linux 或 Mac 上：

在 Windows 上：

3、在包含 main.go 的目錄中的命令行中，通過鍵入go run來運行代碼。

連接成功了！

接下來，您將查詢一些數(shù)據。

Go語言基礎語法（一）

本文介紹一些Go語言的基礎語法。

先來看一個簡單的go語言代碼：

go語言的注釋方法：

代碼執(zhí)行結果：

下面來進一步介紹go的基礎語法。

go語言中格式化輸出可以使用 fmt 和 log 這兩個標準庫，

常用方法：

示例代碼：

執(zhí)行結果：

更多格式化方法可以訪問中的fmt包。

log包實現(xiàn)了簡單的日志服務，也提供了一些格式化輸出的方法。

執(zhí)行結果：

下面來介紹一下go的數(shù)據類型

下表列出了go語言的數(shù)據類型：

int、float、bool、string、數(shù)組和struct屬于值類型，這些類型的變量直接指向存在內存中的值；slice、map、chan、pointer等是引用類型，存儲的是一個地址，這個地址存儲最終的值。

常量是在程序編譯時就確定下來的值，程序運行時無法改變。

執(zhí)行結果：

執(zhí)行結果：

Go 語言的運算符主要包括算術運算符、關系運算符、邏輯運算符、位運算符、賦值運算符以及指針相關運算符。

算術運算符：

關系運算符：

邏輯運算符：

位運算符：

賦值運算符：

指針相關運算符：

下面介紹一下go語言中的if語句和switch語句。另外還有一種控制語句叫select語句，通常與通道聯(lián)用，這里不做介紹。

if語法格式如下：

if ... else ：

else if：

示例代碼：

語法格式：

另外，添加 fallthrough 會強制執(zhí)行后面的 case 語句，不管下一條case語句是否為true。

示例代碼：

執(zhí)行結果：

下面介紹幾種循環(huán)語句：

執(zhí)行結果：

執(zhí)行結果：

也可以通過標記退出循環(huán)：

--THE END--

Go語言os標準庫常用方法Getwd/Getenv/Chdir

1. os.Getwd()函數(shù)

原型：func Getwd()(pwd string, err error)

作用：獲取當前文件路徑

返回：當前文件路徑的字符串和一個err信息

示例：

輸出：

當前路徑： D:ProjectsGomGoLab01

2. os.Getenv()函數(shù)

原型：func Getenv(key string) string

作用：獲取系統(tǒng)環(huán)境變量的值

參數(shù)：key - 系統(tǒng)環(huán)境變量名

返回：系統(tǒng)環(huán)境變量的值

示例：

輸出：

環(huán)境變量GOPATH的值是： D:/Projects/Go

3. os.Chdir()函數(shù)

原型：func Chdir(dir string) error

作用：將當前文件路徑改變?yōu)槟繕寺窂剑ǚ钦鎸嵏淖儯?/p>

參數(shù)：dir - 目標路徑（即改變之后的路徑）

返回：修改成功，返回 nil；修改失敗（如：目標路徑不存在的情況），返回錯誤信息。

示例一：

輸出：

起始路徑： D:ProjectsGomGoLab01

修改后的路徑： D:ProjectsGoDemo02

示例二：

輸出：

起始路徑： D:ProjectsGomGoLab01

error: chdir D:ProjectsGoDemo03: The system cannot find the file specified.

注：文件路徑，Window 系統(tǒng)下默認是“”，寫在代碼中時要用“”或“/”代替。

網頁標題：go語言常用庫方法講解 go語言實現(xiàn)
當前網址：http://www.muchs.cn/article12/hhoodc.html

成都網站建設公司_創(chuàng)新互聯(lián)，為您提供定制開發(fā)、全網營銷推廣、云服務器、標簽優(yōu)化、網站導航、網站維護

廣告

聲明：本網站發(fā)布的內容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉載內容為主，如果涉及侵權請盡快告知，我們將會在第一時間刪除。文章觀點不代表本網站立場，如需處理請聯(lián)系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內容未經允許不得轉載，或轉載時需注明來源： 創(chuàng)新互聯(lián)