linux文本查找命令行 linux 文本查找命令

Linux文本操作常用命令

在Linux系統(tǒng)里常用于文本查看、操作、統(tǒng)計的命令：

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通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）

接下來通過示例把10個命令的常用參數(shù)和用法展示出來：

參數(shù)的用法介紹：

注意事項：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看

結(jié)合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比較少

3.1 less命令

less [參數(shù)] 文件名

less命令重要的補充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵

less命令重要的補充用法2 ：

參數(shù)用法：

less命令 不加參數(shù) 查看文件：

less命令加 -N參數(shù) 查看文件：顯示行號

less命令加 -S參數(shù) 查看文件：單行顯示，非常規(guī)整

對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好

查看壓縮文件

wc 統(tǒng)計字符是也把換行符統(tǒng)計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。

常見參數(shù):

切記：用less命令，按q退出

cut命令是按關鍵詞來切的

常見參數(shù):

排列前：

排列后：

解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一個表格結(jié)構時，因為制表符對齊的原因，出現(xiàn)一個錯位的現(xiàn)象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數(shù) ， 讓數(shù)值有數(shù)學意義上的大小來排序 。

uniq命令去重，只有兩行出現(xiàn)重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現(xiàn)兩行一模一樣，不會去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

換其它文件試試

總之，uniq命令使用時經(jīng)常和sort一起

常見參數(shù):

常見用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常見用法2 : paste - -

常見參數(shù):

要養(yǎng)成一個好習慣，原始數(shù)據(jù)不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符傳遞給 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的內(nèi)容

3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列

4. 在第3步的基礎上排序、去重復并統(tǒng)計

5. 在第4步的基礎上，將空格替換成制表符

補充小知識 ：

清屏 ：control L

查看歷史（輸入過的）命令 ：history

linux查看較長或較短的純文本文件使用哪些命令

在命令行里顯示文本文件內(nèi)容：

cat：在命令行里顯示文本文件內(nèi)容，可以滾屏的（但是不方便把內(nèi)容輸出到其他文件，所以一般腳本內(nèi)部都用cat，less可以在調(diào)用腳本的時候用）。

less：在命令行里編輯文本文件。

vi：在圖形界面打開文本文件。

gedit，kate等等：在圖形界面打開任意文件或者url（gnome）。

命令作用

grep、fgrep和egrep命令這組命令以指定模式搜索文件，并通知用戶在什么文件中搜索到與指定的模式匹配的字符串，并打印出所有包含該字符串的文本行，在該文本行的最前面是該行所在的文件名。grep命令一次只能搜索一個指定的模式；egrep命令檢索擴展的正則表達式（包括表達式組和可選項）；fgrep命令檢索固定字符串，它不識別正則表達式，是快速搜索命令。

linux 命令行下如何查看文件內(nèi)容

linux 命令行中cat命令可以直接打開我們想要查看的文件內(nèi)容。比如part1.txt文件是一首詩詞，可以用此命令：[lichao@localhost test]$ cat part1.txt

擴展資料：

linux 命令行中查看文件類型：

file是一個非常便捷的命令，用它可以探測文件的字符編碼。如下我們創(chuàng)建了兩個文件

[lichao@localhost test]$ ls -l

total 288

-rw-rw-r--. 1 lichao lichao? ? ? 4 Aug 24 15:31 abc.txt

-rw-rw-r--. 1 lichao lichao 285310 Aug 24 15:26 all.txt

通過file命令來查看下文件的字符集編碼：

[lichao@localhost test]$ file abc.txt?

abc.txt: ASCII text

[lichao@localhost test]$ file all.txt

all.txt: UTF-8 Unicode text, with CRLF, CR, LF line terminators

[lichao@localhost test]$

其中?abc.txt?是?ASCII?編碼，而 all.txt 是?UTF-8?編碼，這有助于我們在打開含有中文的文件時，定位出現(xiàn)亂碼的原因。

linux查找內(nèi)容命令

find，用于在文件樹中查找文件并作相應的處理

-name：按照文件名查找文件

-perm：按照文件權限查找文件

-user：按照文件屬主來查找文件

-size：按照指定的文件大小查找文件【+n：大于，-n：小于，n：等于】

-group：按照文件所屬的組來查找文件

-mtime-n+n：按照文件更改時間來查找文件，-n表示n天之內(nèi)，+n表示n天以前

-newer file1 file2：查找更改時間在file1和file2之間的文件

例如：

find -mtime -2：查找48小時修改過的文件

find -name ".log"：查找當前目錄以".log"結(jié)尾的文件

find /opt/soft/test -perm 777：查找指定目錄下權限為777的文件

find -type f -name "*.log"：查找當前目錄下以".log"結(jié)尾的普通文件

find -type d | sort：查找當前所有目標目錄并排序

find /home/wansw -size +20M：查找大于20M的文件

locate指令，可以快速定位文件路徑，利用事先建立的系統(tǒng)中的所有文件名稱和路徑的locate數(shù)據(jù)庫，無需遍歷整個文件系統(tǒng)，查詢速度較快，為了保證查詢準確性，需要定期更新。《Linux就該這么學》

updatedb：第一次運行前，創(chuàng)建locate數(shù)據(jù)庫

grep，用于過濾/搜索指定字符串?？梢允褂谜齽t表達式，能配合多種命令使用。

用法：grep 【選項】 查找內(nèi)容 源文件

-A：顯示符合的行及之后的內(nèi)容

-B：顯示符合的行及之前的內(nèi)容

-C：顯示符合的行及前后的內(nèi)容

-c：計算符合的行數(shù)目

-n：顯示匹配行和行號

-i：忽略大小寫

規(guī)則表達式

：'grep'表示匹配所有以grep開頭的行

'表示匹配所有以grep結(jié)尾的行

.：'gr.p'表示匹配'gr'后面接任意字符然后是'p'

：'grep'表示匹配一個或多個空格后緊跟grep的行

[]：[Gg]rep表示匹配Grep與grep

[]：[A-FH-Z]rep表示匹配不以A-F、H-Z開頭并緊跟rep的行

例如（grep命令大多數(shù)時候多要和別的命令一起使用才有意義）：

ps -ef | grep -c SVN：查找指定的進程的個數(shù)

cat test.txt | grep -f test2.txt：從text2.txt中讀取關鍵字后在test.txt中搜索

cat test.txt | grep nf text2.txt：從text2.txt中讀取關鍵字后在text.txt中搜索并顯示行號

grep 'linux' text.txt test2.txt：從多個文件中搜索關鍵字'linux'

cat test.txt | grep -E 'ed|at'：顯示包含ed或at的行

本文標題：linux文本查找命令行 linux 文本查找命令
標題路徑：http://www.muchs.cn/article32/hhehpc.html

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