LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用

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lncRNA可以作為miRNA sponge與miRNA發(fā)生相互作用,通過競爭性的結(jié)合miRNA, 可以調(diào)控其他基因的表達(dá)量, 發(fā)揮ceRNA的調(diào)控功能。

隨著ceRNA研究的不斷進(jìn)展,相關(guān)文獻(xiàn)越來越多,LncCeRbase數(shù)據(jù)庫收集整理已發(fā)表文獻(xiàn)中人類相關(guān)的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA信息,網(wǎng)址如下

http://lnccerbase.it1004.com/front/

該數(shù)據(jù)庫將ceRNA相關(guān)信息拆分成了以下4種類別

  1. MiRNA

  2. LncRNA

  3. Gene

  4. Disease

根據(jù)任意一種類別,都可以得到相關(guān)的ceRNA信息,示意如下

LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用

對于LncRNA, 提供了RNAcentral數(shù)據(jù)庫的鏈接;對于miRNA, 提供了mirBase數(shù)據(jù)庫的鏈接;對于Gene,提供了NCBI數(shù)據(jù)庫的鏈接。

對于ceRNA,給出了文獻(xiàn)的標(biāo)題,對應(yīng)的疾病或者組織,發(fā)表期刊,pubmed Id。

通過這個數(shù)據(jù)庫,我們可以得到lncRNA相關(guān)的ceRNA信息,既可以作為前期研究的一個調(diào)研,也可以通過別人發(fā)表的ceRNA文獻(xiàn),參考其中分析ceRNA的思路和策略。

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文章題目:LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用
文章起源:http://muchs.cn/article0/gesioo.html

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