Linuxsam命令 linux配置samba

請(qǐng)問(wèn)哪位知道linux下sam格式轉(zhuǎn)成bed文件格式的命令

，一般格式：PED/MAP 2，轉(zhuǎn)置格式：TPED/TFAM 3，二進(jìn)制格式：BED/BIM/FAM 幾種格式之間可以相互轉(zhuǎn)換。推薦使用BED/BIM/FAM這種格式，讀取速度快。

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view命令中，對(duì)sam文件頭部的輸入( -t 或 -T )和輸出( -h )是單獨(dú)的一些參數(shù)來(lái)控制的。

這是dos格式與unix格式間的區(qū)別 ff=fileformat， 是設(shè)置文件格式為unix類型，即換行符為\n。

deb格式的安裝文件應(yīng)該使用dpkg命令安裝，dpkg 是“Debian Packager ”的簡(jiǎn)寫，為 “Debian” 專門開發(fā)的套件管理系統(tǒng)。

convert命令 ，例如：把D盤轉(zhuǎn)換為ntfs格式（而且不傷害數(shù)據(jù)）就是 輸入 convert D：/fs：ntfs 回車，會(huì)要求輸入D盤卷標(biāo)，建議首先把磁盤卷標(biāo)修改成英文，方便輸入。

Linux命令有很多，那么Linux文件系統(tǒng)操作命令又有哪些呢？下面我為你介紹！ 文件系統(tǒng)操作命令： cat：可以顯示文件的內(nèi)容(經(jīng)常和more搭配使用)，或?qū)⒍鄠€(gè)文件合并成一個(gè)文件。

linux如何利用root用戶修改其他用戶的密碼,在不知道其他用戶的密碼的情...

1、首先，用root用戶登陸Linux系統(tǒng)或者使用su、sudo等命令提升到root權(quán)限。

2、首先，用root用戶登陸Linux系統(tǒng)或者使用su、sudo等命令提升到root權(quán)限。其次，修改帳戶密碼，只需要使用passwd命令即可，該命令詳細(xì)介紹如下：passwd 選項(xiàng) 用戶名 可使用的選項(xiàng)：-l 鎖定口令，即禁用賬號(hào)。-u 口令解鎖。

3、linux管理員忘記root密碼，需要進(jìn)行找回操作。 注意事項(xiàng)：本文基于centos7環(huán)境進(jìn)行操作，由于centos的版本是有差異的，繼續(xù)之前請(qǐng)確定好版本。重啟系統(tǒng)，在開機(jī)過(guò)程中， 快速按下 鍵盤上的方向鍵 ↑ 和 ↓ 。

4、root用戶通常可以在不需要知道用戶原密碼的情況下修改所有用戶的密碼，只需要輸入密碼passwd用戶名即可，按照提示兩次輸入新密碼就能夠設(shè)置完成。如果密碼在設(shè)置過(guò)程中不符合復(fù)雜度，系統(tǒng)會(huì)提示，但不會(huì)阻止設(shè)置完成。

Linux如何創(chuàng)建用戶?

1、進(jìn)入Linux系統(tǒng)，登陸管理員賬號(hào)root，只有root才可以添加用戶。輸入useradd+需要添加的用戶名后按回車，useradd是添加用戶命令，的用法為useradd [用戶名]，這里添加用戶名為sample。

2、進(jìn)入Linux系統(tǒng)，登陸管理員賬號(hào)root，只有root才可以添加用戶。輸入useradd+需要添加的用戶名后按回車，useradd是添加用戶命令，的用法為useradd[用戶名]，這里添加用戶名為sample。

3、username 是您想要?jiǎng)?chuàng)建的用戶名：adduser username 按照提示設(shè)置新用戶的密碼。您可以選擇為新用戶設(shè)置其他詳細(xì)信息，如全名、聯(lián)系方式等等。完成上述步驟后，您可以以新用戶身份重新登錄系統(tǒng)，并開始使用您的 Linux 系統(tǒng)了。

samtools常用命令詳解

1、samtools還有個(gè)非常重要的命令mpileup，以前為pileup。該命令用于生成bcf文件，再使用bcftools進(jìn)行SNP和Indel的分析。bcftools是samtool中附帶的軟件，在samtools的安裝文件夾中可以找到。

2、默認(rèn)情況，samtools view輸出序列到屏幕，可以重導(dǎo)向到別的文件。-b ：聲明輸出為bam格式的文件。

3、建立索引 建立索引只需在Linux下輸入命令：samtools faidx input.fa 這里序列文件為 input.fa，生成的索引文件以 .fai 結(jié)尾。

4、最終得到的samtools_result.bcf 是二進(jìn)制文件，到此完成了call snp的第一步。

5、當(dāng)存在多個(gè)樣本的bam文件時(shí)，可以通過(guò)SAMtools的merge命令實(shí)現(xiàn)。guan 方說(shuō)明書：http：// samtools merge要求是對(duì)排序后的bam文件進(jìn)行合并，生成和現(xiàn)在順序一樣的bam文件。

6、sam文件轉(zhuǎn)換為bam文件——SAMtools - (jianshu點(diǎn)抗 )默認(rèn)是按序列在fasta文件中的順序（即header）和序列從左往右的位點(diǎn)排序。

linux查看路徑命令

ls命令 LS命令用于查看目錄的內(nèi)容。默認(rèn)情況下，此命令將顯示當(dāng)前工作目錄的內(nèi)容。如果要查看目錄的內(nèi)容，請(qǐng)鍵入ls，然后鍵入目錄的路徑。cat命令 cat（連接的縮寫）是Linux中最常用的命令之一。

linux命令如果記不得，可以使用man命令來(lái)查看某個(gè)命令的使用。

首先，連接相應(yīng)linux主機(jī)，進(jìn)入到linux命令行狀態(tài)下，等待輸入shell指令。在linux命令行下輸入shell指令：last -f /var/log/wtmp。鍵盤按“回車鍵”運(yùn)行shell指令，此時(shí)會(huì)看到系統(tǒng)的開啟、關(guān)閉、重啟日志。

在Linux環(huán)境下，查看當(dāng)前路徑下的文件和文件夾命令是（）。

linux一條命令能創(chuàng)建多個(gè)用戶組嗎?

在 Linux 系統(tǒng)中，可以使用 usermod 命令來(lái)批量將用戶添加到某一組中。

創(chuàng)建用戶命令useradd useradd命令用于創(chuàng)建用戶，默認(rèn)情況下只有系統(tǒng)超級(jí)用戶root才能使用。由于用戶的屬性有很多，所以該命令的選項(xiàng)也有很多，這里不全部介紹，只說(shuō)幾個(gè)常用的選項(xiàng)。

如圖，準(zhǔn)備條件。創(chuàng)建用戶liulill賦予密碼。創(chuàng)建用戶組thisis1/thisis2/thisis3。如圖，注意格式 查看是否成功。切換用戶輸入id命令。結(jié)果如下圖 已成功加入多個(gè)用戶組。

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