vasp中l(wèi)inux命令 vasp instructor

安裝vasp時(shí),出現(xiàn)如下錯(cuò)誤,應(yīng)該怎么解決,求助

可以考慮使用 KPAR 并行，這個(gè)經(jīng)測(cè)試沒(méi)問(wèn)題 順便搜了一下vasp并行策略的問(wèn)題，根據(jù)guan 方的PPT里說(shuō)的，KPAR是k點(diǎn)并行是最有效率的，NPAR是能帶并行次之。

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vasp運(yùn)行中斷，出現(xiàn)unknown怎么回事 檢查下你的POSCAR是否有問(wèn)題。

段錯(cuò)誤了，沒(méi)有運(yùn)行，只看程序的錯(cuò)誤有fin=fopen(pdata，r)；沒(méi)有檢查fin的有效性，當(dāng)打開(kāi)文件失敗時(shí)，訪問(wèn)fin會(huì)造成段錯(cuò)誤，去掉引號(hào)中的空格，并檢查fin是否有效。

集群上使用的是openmpi，PBS有點(diǎn)問(wèn)題，所以我一直用命令“mpirun -np 8 vasp”提交任務(wù)。不知道如何使用命令進(jìn)行多節(jié)點(diǎn)的并行計(jì)算（把一個(gè)任務(wù)分配到多個(gè)節(jié)點(diǎn)上）。

POTCAR 將要告訴vasp計(jì)算的系統(tǒng)中所包含的各種元素的贗勢(shì) pesudopotential，vasp本身就帶有比較完善的贗勢(shì)包，我們需要做的就是選擇我們需要具體哪種贗勢(shì)，然后把相應(yīng)的文件拷貝形成我們具體的POTCAR文件。我們以GaAs為例。

求助Linux系統(tǒng)下MS5.5和VASP的計(jì)算

不知道你是想要vasp的并行安裝過(guò)程還是vasp的并行執(zhí)行。 由于知道不能提供文檔上傳，所以有需要的話可以給我發(fā)站內(nèi)信息。我用郵箱把我自己寫(xiě)的vasp安裝過(guò)程給你發(fā)過(guò)去。

如果是集群，還需提交作業(yè)的腳本 vasp.job 如下 提交作業(yè) 計(jì)算結(jié)束后， cat out 查看體系是否收斂，如收斂則進(jìn)入下一步計(jì)算。

單從軟件上手、使用、分析數(shù)據(jù)角度，毫無(wú)疑問(wèn)是VASP更方便，但是ASTEP(Linux)現(xiàn)在學(xué)術(shù)免費(fèi)，可以向guan 方申請(qǐng)得到的比較新的版本(CASTEP19)，而MS-CASTEP據(jù)我所知里面的CASTEP模塊是比較老的版本(具體哪個(gè)版本不確定)。

Linux系統(tǒng)中aaa-vasp.sh是什么意思

linux中.sh文件是腳本文件，一般都是bash腳本。腳本文件英文為Script。實(shí)際上腳本就是程序，一般都是由應(yīng)用程序提供的編程語(yǔ)言。

sh命令是shell命令語(yǔ)言解釋器，執(zhí)行命令從標(biāo)準(zhǔn)輸入讀取或從一個(gè)文件中讀取。通過(guò)用戶輸入命令，和內(nèi)核進(jìn)行溝通！Bourne Again Shell (即bash)是自由軟件基金會(huì)(GNU)開(kāi)發(fā)的一個(gè)Shell，它是Linux系統(tǒng)中一個(gè)默認(rèn)的Shell。

sh是linux中運(yùn)行shell的命令，是shell的解釋器，shell腳本是linux中殼層與命令行界面，用戶可以在shell腳本輸入命令來(lái)執(zhí)行各種各樣的任務(wù)。

sh或是執(zhí)行腳本，或是切換到sh這個(gè)bash里，默認(rèn)的shell是bash，你可以試試tcsh啊，csh啊，ksh，zsh什么的，看看別的shell是什么樣子的。當(dāng)然，linux中sh是鏈接到bash上的，所以sh與bash在功能上是沒(méi)有區(qū)別的。

因?yàn)閕p.sh是個(gè)腳本，所在的位置，并沒(méi)有加到PATH這個(gè)環(huán)境變量里。所以運(yùn)行時(shí)，系統(tǒng)搜不到這個(gè)命令，要執(zhí)行：./ip.sh 告訴系統(tǒng)這個(gè)腳本在當(dāng)前目錄下。

第一行的“#！ /bin/sh”不要少。有了這行定義，系統(tǒng)就知道你寫(xiě)的是一個(gè)shell腳本，另外你的腳本缺少可執(zhí)行權(quán)限，需要使用chmod +x aaa.sh命令將可執(zhí)行權(quán)限添加上去，這樣，就可以使用./aaa.sh來(lái)執(zhí)行這個(gè)腳本了。

vasp運(yùn)行中斷,出現(xiàn)unknown怎么回事

1、出現(xiàn)這種情況一般從硬件和軟件兩個(gè)方面考慮，硬件方面主要發(fā)生在內(nèi)存上，軟件方面則有可能是電腦中病毒了，收到了病毒程序的干擾，或是安裝了一些與自身電腦不兼容的軟件等。

2、應(yīng)該是內(nèi)存不足，沒(méi)有寫(xiě)入EIGENVAL文件 不過(guò)也沒(méi)有關(guān)系，實(shí)際上此時(shí)的能量本征值都寫(xiě)入了OUTCAR了。也很容易從這兒提取能帶的信息。

3、unknown software exception (0x*00000**)，位置為0x0***0 這個(gè)問(wèn)題大多是殺毒殘留，但也有可能是你卸載某個(gè)軟件不正確留下的注冊(cè)表殘留。

4、散一般出現(xiàn)這個(gè)現(xiàn)象有方面的，一是硬件，即內(nèi)存方面有問(wèn)題，二是軟件，這就有多方面的問(wèn)題了。

5、在“開(kāi)始”菜單里面點(diǎn)“運(yùn)行”輸入“cmd”，對(duì)電腦進(jìn)行調(diào)試，具體步驟如下。首先將usb設(shè)備插入計(jì)算機(jī)接口，然后在桌面左下角單擊“開(kāi)始”菜單，單擊“運(yùn)行”命令，打開(kāi)框中鍵入“cmd”命令，單擊“確定”按鈕。

6、解決方法 步驟一：停用 USB 0 控制器 根據(jù)不同的操作系統(tǒng)做以下操作：在 Windows 2000 Pro 操作系統(tǒng)中，依次點(diǎn)擊“開(kāi)始”→“控制面板”→“系統(tǒng)”。

求助一個(gè)關(guān)于Linux下的VASP故障的問(wèn)題

1、ERROR FEXCF： supplied exchange-correlation table is too small， maximal index ： 912695 這個(gè)問(wèn)題是由于intel編譯器的問(wèn)題，（我猜）天河上用intel可能是2013 or 2015。

2、用VASP DFT計(jì)算能帶時(shí)我需要考慮自旋軌道耦合（SOC）我的問(wèn)題如下：（1）計(jì)算時(shí)，在INCAR中加入SOC的參數(shù)，是考慮在SCF自洽時(shí)加，還是在 band計(jì)算加入。

3、VASP程序用多了，經(jīng)常目錄下會(huì)留下不少的WAVECAR，CHGCAR等文件。如果不用的話，占用很大的磁盤(pán)空間。

4、請(qǐng)教一下大家一些問(wèn)題，我用的軟件是VASP：首先對(duì)于吸附計(jì)算來(lái)說(shuō)，一開(kāi)始要進(jìn)行吸附材料的結(jié)構(gòu)優(yōu)化計(jì)算。

虛擬機(jī)下的linux安裝VASP可行么

1、redhat4 可以直接su 然后輸入你裝系統(tǒng)設(shè)置的密碼，進(jìn)到root下。

2、裝VASP運(yùn)行肯定是可以的，只是計(jì)算稍大點(diǎn)的體系速度就慢得要命了，你可以直接裝linux系統(tǒng)或是裝虛擬機(jī)的linux系統(tǒng)。完成某個(gè)獨(dú)立任務(wù)的程序及其所需的數(shù)據(jù)組成一個(gè)作業(yè)。

3、啟動(dòng)Windows 10操作系統(tǒng)，點(diǎn)擊任務(wù)欄開(kāi)始按鈕，彈出開(kāi)始菜單選擇VMware→VMware Workstation項(xiàng)。喚出VMware Workstation 10程序窗口。點(diǎn)擊創(chuàng)建新的虛擬機(jī)圖標(biāo)，通過(guò)虛擬機(jī)安裝操系統(tǒng)。

4、linux下的可執(zhí)行圖標(biāo)和shell終端圖標(biāo)很像 E、到/usr/bin目錄里找安裝的軟件啟動(dòng)文件執(zhí)行命令。

5、下載一個(gè)redhat，因?yàn)閞edhat已經(jīng)商業(yè)化了，推薦大家使用centos，如果自己有合適的linux安裝版本，可以不使用這個(gè)。

6、用戶可以通過(guò)vmware、virtualbox等虛擬機(jī)來(lái)安裝linux系統(tǒng)。使用虛擬機(jī)來(lái)安裝linux主要分為兩步，第一步是創(chuàng)建虛擬機(jī)，第二步是安裝系統(tǒng)，接下來(lái)以virtualbox安裝centos為例來(lái)簡(jiǎn)要說(shuō)明安裝步驟，僅供參考。

本文標(biāo)題：vasp中l(wèi)inux命令 vasp instructor
瀏覽路徑：http://muchs.cn/article12/dihoodc.html

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