小編給大家分享一下dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!
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為了探究miRNA在腫瘤發(fā)生與發(fā)展中的角色,有過去的幾十年間,有很多的文章和數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)表,通過整合公開發(fā)表的數(shù)據(jù),dbDEMC的開發(fā)團隊提供了一個在線網(wǎng)站,可以方便的查詢在某種腫瘤中特定miRNA的表達趨勢,網(wǎng)址如下
http://www.picb.ac.cn/dbDEMC/
該數(shù)據(jù)庫目前收錄了2224個miRNA, 36種腫瘤,73種腫瘤亞型,209個miRNA在腫瘤中的表達譜數(shù)據(jù),示意如下
其中乳腺癌的相關記錄是最多的,各個腫瘤比例如下圖所示
通過Search
功能,可以針對特定的miRNA進行檢索,只需要輸入miRNA的ID即可,檢索框示意如下
檢索結果如下所示,給出了相關的GEO編號,腫瘤類型,細胞系,上下調(diào)趨勢等信息
通過Browse
功能,可以通過腫瘤類型瀏覽相關記錄,示意如下
結果以Experiment
為單位進行展示,示意如下
勾選最后一列的單選框,通過View miRNAs
按鈕,可以查看具體的miRNA列表。
通過meta-profiling
功能,可以查看miRNA在特定實驗中的表達譜數(shù)據(jù),結果以熱圖進行展示,示意如下
通過該數(shù)據(jù)庫,可以方便的檢索已有的miRNA在腫瘤領域的相關研究,不論是前期調(diào)研,還是后期根據(jù)自己的數(shù)據(jù)進行驗證,都非常的有用。
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標題名稱:dbDEMC是一個什么數(shù)據(jù)庫
網(wǎng)址分享:http://muchs.cn/article34/pioipe.html
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