BioGRID數(shù)據(jù)庫有什么用

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BioGRID數(shù)據(jù)庫是一個老牌經(jīng)典的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫，在今年9月份剛剛分布了最新版本3.5.165，該版本從66,164篇文獻(xiàn)中整理出了1,607,037個蛋白質(zhì)相互作用，28,093個嵌合體信息以及726,378個轉(zhuǎn)錄后修飾PTM信息，涵蓋了多個物種，官網(wǎng)地址如下

https://thebiogrid.org/

通過官網(wǎng)的檢索功能，可以根據(jù)基因或者蛋白標(biāo)識符進行檢索，示意如下

在檢索頁面主要分成以下3大部分

1. 基本描述信息

示意結(jié)果如下，包含了蛋白質(zhì)的名稱，別名，轉(zhuǎn)錄后修飾，即UBI對應(yīng)的行，GO注釋信息，和其他數(shù)據(jù)庫的鏈接

2. 統(tǒng)計信息

示意如下，統(tǒng)計每種相互作用類型的數(shù)目和比例

3. 詳細(xì)結(jié)果頁面

示意如下，可以查看Interactors等詳細(xì)信息

通過Network菜單，可以顯示該蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)，示意如下

BioGRID數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)是免費開放下載的，下載鏈接如下

https://downloads.thebiogrid.org/BioGRID

和其他數(shù)據(jù)庫類似，同時提供了TAB和XML格式供下載。

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